Theo cáo trạng, trong khoảng thời gian từ năm 2013 đến tháng 6-2016, Ánh làm thủ quỹ kiêm kế toán quản lý các khoản tiền thu phí, lệ phí đất đai tại Chi nhánh Văn phòng Đăng ký quyền sử dụng đất huyện Phú Quốc. Để có tiền tiêu xài cá nhân, Ánh bôi xóa, sửa chữa số tiền ghi trên 128 biên lai thu phí và lệ phí (lai lưu) sao cho thấp hơn số tiền trên biên lai đã thu để chiếm đoạt gần 2,5 tỷ đồng.
Trong khi đó, Trần Văn Hoàng và Trần Văn Kiên là Giám đốc và Phó Giám đốc lại không thực hiện đúng chức trách nhiệm vụ được giao trong việc quản lý, điều hành tài chính và chủ quan trong việc kiểm tra, đối chiếu chứng từ quyết toán giữa tờ khai phí, lệ phí và bảng kê thanh toán ấn chỉ với biên lai thu theo quy định. Từ đó, tạo cho Ánh chiếm đoạt số tiền rất lớn.
Ngoài bản án, các bị cáo Phạm Thị Ngọc Ánh, Trương Văn Hoàng và Trần Văn Kiên bồi thường ngân sách Nhà nước gần 2,5 tỷ đồng; trong đó Hoàng chịu trách nhiệm bồi hoàn hơn 220 triệu đồng, Kiên hơn 1,8 triệu đồng.
