Năm 2012, trước tình hình các kiến trúc và cơ sở hạ tầng của hội quán xuống cấp trầm trọng, UBND TPHCM cho phép tiến hành sửa chữa khẩn cấp chánh điện vì có nguy cơ đổ ngã do một số xà ngang bị cong, gãy và bị mối mọt phá hoại. Sau khoảng 10 năm trùng tu với 2 đợt quyên góp, công trình tu sửa - tôn tạo hội quán hoàn tất với kinh phí gần 29 tỷ đồng.
Hội quán Nhị Phủ được xây dựng năm 1728, lễ khánh thành công trình dịp này hướng đến kỷ niệm 300 năm thành lập hội quán.
