Theo thống kê, tổng số cơ sở nhà đất của cả hai địa phương là 4.291 cơ sở, diện tích đất hơn 18,8 triệu m2 và diện tích sàn sử dụng hơn 6,2 triệu m2. Trong đó, Đà Nẵng có 1.681 cơ sở, Quảng Nam có 2.610 cơ sở. Sau hợp nhất, thành phố sẽ bố trí lại trụ sở các cơ quan, đơn vị trên nguyên tắc tiết kiệm, hiệu quả và phù hợp với quy mô tổ chức bộ máy.
Cơ quan Đảng và đơn vị sự nghiệp của Đảng cơ bản tiếp tục làm việc tại trụ sở hiện có ở Đà Nẵng. Trường Chính trị sẽ có thêm cơ sở tại Tam Kỳ để phục vụ nhu cầu đào tạo. Văn phòng Thành ủy đề xuất sử dụng trụ sở cũ của Tỉnh ủy Quảng Nam để phục vụ công tác lưu trữ, chỉnh lý và số hóa tài liệu.
Việc bố trí lại trụ sở các sở, ngành được cân nhắc trên cơ sở hiện trạng cơ sở vật chất, biên chế và nhu cầu sử dụng thực tế. Một số sở sẽ làm việc tại Trung tâm Hành chính thành phố, số khác chuyển về trung tâm hành chính các quận hoặc trụ sở riêng lẻ trên địa bàn.
Ngoài ra, thành phố sẽ chuyển đổi công năng 26 cơ sở phục vụ y tế, giáo dục, sinh hoạt cộng đồng và bố trí 11 cơ sở làm trụ sở cho các lực lượng vũ trang. Đặc biệt, có 145 cơ sở nhà đất dôi dư, trong đó phần lớn nằm tại quận Hải Châu, Sơn Trà và Ngũ Hành Sơn. Các cơ sở này sẽ được giao cho các đơn vị chức năng để quản lý, khai thác hiệu quả, tránh lãng phí tài sản công.
