Theo bác sĩ chuyên khoa 2 Trịnh Hữu Tùng, Giám đốc Bệnh viện Nhi đồng 2, bệnh viện hiện có 1.900 giường điều trị nội trú, hơn 1.548 cán bộ công chức, 34 khoa lâm sàng và cận lâm sàng, 10 phòng chức năng.
Trong những năm qua, bệnh viện đã thực hiện thành công nhiều ca ghép tạng, nhất là ghép gan, và tách thành công 1 ca song sinh phức tạp. Mỗi ngày, bệnh viện khám bệnh cho 5.500 - 6.000 bệnh nhi từ khắp các tỉnh - thành, cao điểm có lúc lên đến 7.000 bệnh nhi.
