Trước đó, vào lúc 19 giờ 15 ngày 14-6, trên sông Hậu đoạn thuộc địa phận xã Mỹ Hòa Hưng, thành phố Long Xuyên, tỉnh An Giang xảy ra vụ tai nạn giao thông đường thủy nghiêm trọng.
Ca nô gặp nạn thuộc Đoàn kiểm tra liên ngành tỉnh An Giang khi đang làm nhiệm vụ (kiểm tra hoạt động khai thác khoáng sản và khai thác lớp đất mặt trái phép trên địa bàn tỉnh An Giang).
Đoàn kiểm tra liên ngành có 8 người gồm: ông Phan Văn Nguyên, Thanh tra Sở TN-MT; ông Lê Thành Tân, Thanh tra Sở TN-MT; ông Nguyễn Quốc Phong, chuyên viên Sở TN-MT; ông Nguyễn Văn Dũng, Đội thanh tra an toàn số 7 thuộc Chi cục đường thủy nội địa phía Nam (lái ca nô); ông Nguyễn Văn Tuấn, nhân viên lái tàu xe thuộc Sở TN-MT; Thiếu tá Nguyễn Văn Lê, cán bộ Phòng PC49 (Công an tỉnh); Đại úy Huỳnh Thanh Danh, cán bộ Phòng PC49; ông Trần Việt Hùng, Học viên Trường Cao đẳng CSND II.
Ca nô chở đoàn xuất phát từ cầu Tôn Đức Thắng (thuộc phường Bình Khách, TP Long Xuyên, tỉnh An Giang), chạy trên sông Hậu đến địa bàn thuộc xã cù lao Mỹ Hòa Hưng (TP Long Xuyên) thì bất ngờ va chạm mạnh với chiếc sà lan biển kiểm soát KG 57199; 290 CV, do ông Phan Thanh Hùng (ở TP Rạch Giá, tỉnh Kiên Giang) làm chủ, đang neo đậu.
Do va chạm rất mạnh đã khiến ông Nguyễn Văn Dũng, Đội thanh tra an toàn số 7 thuộc Chi cục đường thủy nội địa phía Nam (người lái ca nô) chết tại chỗ; Đại úy Huỳnh Thanh Danh, cán bộ Phòng PC49 mất tích; Thiếu tá Nguyễn Văn Lê, cán bộ Phòng PC49 và ông Trần Việt Hùng, học viên Trường Cao đẳng CSND II, bị thương nặng được đưa lên TPHCM điều trị, đến nay sức khỏe dần ổn định.
Riêng Đại úy Huỳnh Thanh Danh bị mất tích, sau vụ tai nạn các ngành chức năng ở An Giang huy động nhiều lực lượng và phương tiện triển khai tìm kiếm liên tục, phạm vi tìm kiếm cũng được mở rộng hàng chục kilômét cách nơi xảy ra tai nạn.
Tuy nhiên, do thời điểm này mực nước ở sông Hậu chảy xiết, khiến việc tìm kiếm gặp khó khăn.
Sau khoảng 1 tuần nỗ lực tìm kiếm, đến khoảng 18 giờ ngày 21-6, lực lượng chức năng đã tìm thấy thi thể Đại úy Huỳnh Thanh Danh, cách nơi xảy ra tại nạn ca nô khoảng 500m hướng về TP Cần Thơ.