Thông tư nêu rõ, sở y tế là cơ quan chuyên môn thuộc UBND cấp tỉnh, thành phố có tư cách pháp nhân, có con dấu và tài khoản riêng theo quy định của pháp luật; chịu sự chỉ đạo, quản lý về tổ chức, biên chế và hoạt động của UBND cấp tỉnh, thành phố; đồng thời chịu sự chỉ đạo, kiểm tra, hướng dẫn về chuyên môn, nghiệp vụ của Bộ Y tế.
Về nhiệm vụ và quyền hạn, Bộ Y tế quy định sở y tế có 30 nhiệm vụ và quyền hạn. Trong đó, sở y tế trình UBND cấp tỉnh, thành phố dự thảo nghị quyết của HĐND cấp tỉnh, thành phố, dự thảo quyết định của UBND cấp tỉnh, thành phố liên quan đến các lĩnh vực thuộc phạm vi quản lý của Sở Y tế và các văn bản khác theo phân công của UBND cấp tỉnh, thành phố.
Trong Thông tư 20 cũng quy định, phòng văn hóa - xã hội là cơ quan chuyên môn thuộc UBND cấp xã tham mưu, giúp UBND cấp xã thực hiện quản lý nhà nước về lĩnh vực y tế và các lĩnh vực khác theo quy định của pháp luật; đồng thời chịu sự chỉ đạo, quản lý về tổ chức bộ máy, vị trí việc làm, biên chế công chức, cơ cấu ngạch công chức và công tác của UBND cấp xã và chịu sự chỉ đạo, kiểm tra, hướng dẫn chuyên môn, nghiệp vụ về lĩnh vực y tế của sở y tế.
Phòng văn hóa - xã hội có nhiệm vụ tham mưu, giúp UBND cấp xã thực hiện quản lý nhà nước về lĩnh vực y tế, như: y tế dự phòng; khám, chữa bệnh, phục hồi chức năng; bà mẹ, trẻ em; dân số; bảo trợ xã hội; y, dược cổ truyền; dược, mỹ phẩm; an toàn thực phẩm… và các lĩnh vực khác ở địa phương theo quy định của pháp luật.
Giúp UBND cấp xã thực hiện và chịu trách nhiệm về việc thẩm định, đăng ký, cấp các loại giấy phép, giấy chứng nhận và các loại giấy tờ có giá trị tương đương về lĩnh vực y tế thuộc phạm vi trách nhiệm và thẩm quyền của phòng văn hóa - xã hội theo quy định của pháp luật và theo phân công của UBND cấp xã; kiểm tra, xử lý vi phạm trong việc thực hiện các quy định của pháp luật, các quy định chuyên môn, quy chuẩn kỹ thuật về lĩnh vực y tế đối với tổ chức, cá nhân trên địa bàn.
