Tùy theo đăng ký, thí sinh làm một hoặc hai môn trong số các môn: Vật lý, Hóa học, Sinh học, Lịch sử, Địa lý, Giáo dục kinh tế và pháp luật, Tin học, Công nghệ (Công nghiệp, Nông nghiệp) và Ngoại ngữ. Mỗi môn thi có thời gian làm bài 50 phút.
Theo lịch thi, môn thi thứ nhất được phát đề lúc 7 giờ 30 phút, thí sinh bắt đầu làm bài từ 7 giờ 35 phút. Môn thi thứ hai được phát đề lúc 8 giờ 35 phút, thí sinh bắt đầu làm bài từ 8 giờ 40 phút.
Buổi thi này có cách tổ chức đặc thù khi có thí sinh chỉ đăng ký dự thi một môn, trong khi nhiều thí sinh khác dự thi hai môn liên tiếp.
Theo quy định, thí sinh chỉ dự thi môn thứ nhất, sau khi nộp phiếu trả lời trắc nghiệm, phải rời phòng thi và di chuyển về phòng chờ. Các em chỉ được rời khỏi khu vực thi sau khi hết giờ làm bài của môn thi cuối cùng. Trong thời gian ở phòng chờ, thí sinh phải giữ trật tự và tuân thủ hướng dẫn của cán bộ coi thi, giám sát phòng thi hoặc người quản lý khu vực chờ.
Đối với thí sinh chỉ dự thi môn thứ hai, các em phải có mặt tại nơi gọi thí sinh vào phòng thi trước giờ phát đề ít nhất 10 phút để làm thủ tục chuẩn bị.
Trước đó, trong ngày thi đầu tiên 11-6, cả nước có 27 thí sinh bị đình chỉ thi do vi phạm quy chế, gồm 16 thí sinh ở môn Ngữ văn và 11 thí sinh ở môn Toán. Trong số này, 25 thí sinh sử dụng điện thoại, 2 thí sinh sử dụng tài liệu.
Chiều 12-6, Bộ GD-ĐT sẽ họp báo thông tin về kỳ thi.