Cơ quan điều tra xác định giai đoạn 2010-2013, trong quá trình cổ phần hóa, để xử lý các vấn đề liên quan, các bị can đã xác định 50 công ty còn nợ Cienco 1 với tổng số 364 tỷ đồng. Trong đó, có 184 tỷ đồng là khoản khó đòi, nên các bị can quyết định xóa, dù đây là tài sản công. Sau khi cổ phần hóa, nhóm bị can này đòi được 65 tỷ đồng trong số 184 tỷ đồng, nhưng không bàn giao tiền cho Nhà nước theo quy định.
Không những thế, quá trình cổ phần hóa, Cienco 1 cũng không bàn giao giá trị quyền sử dụng 4 khu đất (khu đất diện tích 422m2 tại số 135 Nguyễn Văn Đậu, TPHCM; 916m2 tại TP Tân An, tỉnh Long An; 16.706m2 tại Châu Thành, tỉnh Tiền Giang và 852m2 tại TP Pleiku, tỉnh Gia Lai) vào giá trị doanh nghiệp. Từ kết quả giám định, cơ quan điều tra cho rằng hành vi của các bị can trên gây thiệt hại hơn 54,7 tỷ đồng. Đây là vụ án thuộc diện Ban Chỉ đạo Trung ương về phòng, chống tham nhũng, tiêu cực theo dõi, chỉ đạo.
