Khu lọc máu này dùng nguồn nước được xử lý bằng hệ thống xử lý nước theo chất lượng cao nhất đạt tiêu chuẩn của Nhật Bản, màng lọc được dùng lại 2-3 lần.
Theo bác sĩ Võ Đức Chiến, hầu hết các cơ sở y tế sử dụng màng lọc 1 lần cho bệnh nhân chạy thận, nên chi phí khá cao so với thu nhập của nhiều người dân. Trước thực tế đó, BV đã hợp tác với Công ty Nipro, một trong những tập đoàn đa quốc gia hàng đầu thế giới trong lĩnh vực sản xuất vật tư y tế, đặc biệt là sản phẩm cho lọc máu, thiết lập khu lọc máu theo tiêu chuẩn Nhật Bản, trong đó sử dụng lại màng lọc 2-3 lần. Trung tâm có 16 máy được nhập nguyên kiện từ Nhật Bản, với công suất phục vụ được khoảng 100 bệnh nhân chạy thận/tuần.