Chẳng hạn có quận, huyện gặp khó trong việc tiếp cận để tuyên truyền đối với dân lao động nhập cư; chưa phát triển mạng lưới thu gom, phân loại chất thải tại nguồn; phương tiện thu gom rác còn thô sơ, không đảm bảo vệ sinh môi trường trong quá trình thu gom, vận chuyển; chưa xã hội hóa chi phí thu gom, vận chuyển, xử lý rác y tế nguy hại đối với các cơ sở y tế; hạ tầng kỹ thuật phục vụ việc phân loại, thu gom chất thải rắn chưa hoàn chỉnh (phương tiện thu gom, vận chuyển chưa đủ, chưa đồng bộ, chưa có phương thức, mô hình thu gom, vận chuyển hiệu quả…).
Công tác thu thập, cập nhật số liệu chất thải nguy hại từ TPHCM chuyển ra các tỉnh để xử lý hoặc thu gom, vận chuyển chất thải nguy hại từ các tỉnh về TPHCM xử lý gặp nhiều khó khăn do chưa triển khai được công tác kiểm soát, giám sát, thu thập loại chất thải nguy hại này.
