Trung tâm Y tế dự phòng TPHCM được xây dựng với quy mô 5 tầng (1 trệt, 4 lầu) với 8 khoa phòng chức năng và đội ngũ 283 nhân viên. Trong đó, tầng 1 và 2 dự kiến sẽ thực hiện phòng khám tư vấn và điều trị dự phòng, tầng 3 là Khoa kiểm soát bệnh, Khoa sức khỏe môi trường và sức khỏe cộng đồng. Phòng làm việc và kỹ thuật sẽ đặt tại tầng 4 và 5.
Dự kiến, Trung tâm sẽ được xây dựng trong 600 ngày kể từ ngày 3-5-2018, với tổng chi phí đầu tư hơn 79 tỷ đồng.
Phát biểu tại lễ khởi công, GS.TS Nguyễn Tấn Bỉnh, Giám đốc Sở Y tế TPHCM cho rằng, với việc xây dựng mới trụ sở Trung tâm Y tế dự phòng TPHCM sẽ đáp ứng yêu cầu về cơ sở vật chất phục vụ công tác phòng chống dịch bệnh, tiêm phòng, tiêm chủng, bệnh không lây nhiễm, giám sát chất lượng nước sinh hoạt, công tác chuyên môn nghiệp vụ.
Ngoài ra, trung tâm còn điều hành dữ liệu bệnh tật của cả TP và các trung tâm y tế quận huyện trên địa bàn TP.