Trong văn bản, VCCI cho rằng, quy định miễn thuế nhập khẩu đối với đơn hàng TMĐT có giá trị từ 1 triệu đồng trở xuống là chưa phù hợp. Trên thực tế, phần lớn hàng TMĐT có giá trị thấp, đồng nghĩa với phần lớn sẽ không chịu thuế. Điều này tạo ra sự bất bình đẳng với doanh nghiệp trong nước vì vẫn phải nộp thuế nhập khẩu cho nguyên liệu sản xuất. VCCI kiến nghị xây dựng chính sách thuế toàn diện hơn, có thể theo hướng đơn giản hóa biểu thuế, gộp mã HS theo nhóm ngành hàng như Canada đang áp dụng.
Bên cạnh đó, việc miễn kiểm tra với hàng giá trị nhỏ theo từng người mua chưa phù hợp với đặc thù TMĐT khi thông tin về người bán (đặc biệt là người bán nước ngoài) minh bạch và dễ kiểm soát hơn. VCCI đề xuất chuyển hướng sang quản lý theo người bán và áp dụng kiểm tra có chọn lọc dựa trên khối lượng đơn hàng để tăng hiệu quả kiểm soát rủi ro.
Đối với trường hợp không được miễn kiểm tra chuyên ngành, VCCI đề nghị làm rõ thời điểm áp dụng nhằm tránh thiệt hại cho doanh nghiệp khi đơn hàng đã được gửi mà sau đó mới bị từ chối thông quan. Đồng thời, cơ quan hải quan cần thông báo về việc kiểm tra thực tế hàng hóa để doanh nghiệp sử dụng làm căn cứ pháp lý trong xử lý hợp đồng vận chuyển.
Trong trường hợp hệ thống hải quan gặp sự cố, VCCI đề nghị bổ sung quy định cho phép doanh nghiệp tạm khai báo bằng hồ sơ giấy để tránh tình trạng hàng hóa ùn ứ tại cửa khẩu.
