Theo Nghị định, việc khoanh định khu vực dự trữ khoáng sản quốc gia phải đáp ứng quy định của Luật Khoáng sản và không thuộc quy hoạch thăm dò, khai thác, chế biến và sử dụng khoáng sản.
Thời gian dự trữ khoáng sản quốc gia tối đa là 50 năm theo quyết định phê duyệt của Thủ tướng Chính phủ. Trường hợp đặc biệt, đối với một số khu vực, loại khoáng sản đặc thù, thời gian dự trữ khoáng sản quốc gia có thể hơn 50 năm nhưng không quá 70 năm, do Thủ tướng Chính phủ quyết định.
Việc điều chỉnh khu vực dự trữ khoáng sản quốc gia đã phê duyệt được thực hiện trong trường hợp bổ sung vào danh mục khu vực dự trữ khoáng sản quốc gia; đưa ra khỏi danh mục một phần hay toàn bộ khu vực khoáng sản đã khoanh định là khu vực dự trữ khoáng sản quốc gia trong trường hợp để bổ sung vào quy hoạch thăm dò, khai thác, chế biến và sử dụng khoáng sản có liên quan theo quy định hoặc để phục vụ cho mục đích quốc phòng, an ninh. Không thực hiện dự án đầu tư tại khu vực dự trữ khoáng sản quốc gia với các dự án đầu tư có mục đích sử dụng đất đai lâu dài, trừ công trình hạ tầng kỹ thuật phục vụ lợi ích quốc gia, cộng đồng; công trình xây dựng thuộc cấp công trình đặc biệt.
Trong quá trình thực hiện dự án đầu tư tại các khu vực đã khoanh định là khu vực dự trữ khoáng sản quốc gia, chủ đầu tư dự án có trách nhiệm bảo vệ khoáng sản trong phạm vi khu vực. Nghiêm cấm lợi dụng việc thực hiện dự án đầu tư, xây dựng công trình để khai thác khoáng sản nằm trong khu vực dự trữ khoáng sản quốc gia.
Trường hợp vi phạm, ngoài việc bị xử phạt theo quy định của pháp luật, tùy thuộc vào tính chất, mức độ vi phạm, chủ đầu tư dự án còn bị đình chỉ thực hiện dự án đầu tư hoặc thu hồi quyết định chủ trương đầu tư. Tổ chức, cá nhân khi lập hồ sơ đề nghị chấp thuận chủ trương đầu tư dự án tại khu vực dự trữ khoáng sản quốc gia phải có đánh giá tác động, mức độ ảnh hưởng đến tài nguyên, trữ lượng, chất lượng khoáng sản đã được khoanh định là khu vực dự trữ khoáng sản quốc gia; có giải pháp bảo vệ khoáng sản thuộc đối tượng dự trữ trong báo cáo nghiên cứu tiền khả thi...
