Thanh tra TPHCM phát hiện quá trình triển khai thực hiện dự án trên phần đất nhà nước rộng hơn 8.900m² ở vị trí đắc địa của thành phố có nhiều sai phạm, đặc biệt là việc thoái vốn điều lệ của đơn vị nhà nước không đúng chủ trương của UBND TPHCM. Trong vụ việc này, TPHCM cũng chỉ đạo kiểm điểm trách nhiệm cá nhân liên quan đã xác định chỉ tiêu quy hoạch của dự án làm ảnh hưởng công trình Thủy đài (là di tích lịch sử - văn hóa, danh lam thắng cảnh của thành phố).

Cơ quan điều tra xác định, nguyên Chánh thanh tra Sở Tài chính TPHCM và các đồng phạm đã gây thiệt hại hơn 17 tỷ đồng trong việc cải tạo, sửa chữa nhiều trường học ở Củ Chi.