Bảo tàng nằm trong một căn nhà nhỏ có vườn bao quanh. Ngôi nhà này lúc đầu là một tiệm bán bánh mì có đầu hồi nhìn ra phố trong ngôi làng cổ Heiligenstadt chuyên trồng nho nằm dọc theo triền đồi phía Bắc của thành phố Vienna. Nhà soạn nhạc Ludwig van Beethoven khi ấy 32 tuổi, đã thuê căn hộ để dừng chân và chữa bệnh, chủ yếu liên quan đến vấn đề thính giác. Làng Heiligenstadt nổi tiếng về nguồn nước khoáng nóng. Đây chính là nơi Beethoven đã đến theo lời khuyên của bác sĩ. Tiến triển của bệnh điếc đã làm ông lo lắng và cảm thấy xấu hổ, mà bằng chứng là bức thư nổi tiếng mang tên Di chúc Heiligenstadt do ông soạn thảo. Viện bảo tàng là sự kết hợp hài hòa các vật dụng cá nhân của nhà soạn nhạc, những bức tranh, các bản thảo và thư từ. Bộ sưu tập thuật lại cuộc sống thường nhật của Beethoven, những thói quen của ông như những buổi đi dạo ngắm cảnh thiên nhiên hay những mối quan hệ của ông với các mạnh thường quân thuộc tầng lớp quý tộc cao cấp thành Vienna.