Hộ chiếu điện tử có tính năng bảo mật nâng cao, được trang bị các tính năng về sinh trắc học, giúp xác định chính xác công dân được cấp hộ chiếu. Với hộ chiếu điện tử được cá nhân hóa, công dân Uganda có thể tự do xuất cảnh hoặc nhập cảnh mà không bắt buộc phải tương tác với các nhân viên của cơ quan chức năng. Chính phủ Uganda sẽ sớm trang bị các cổng điện tử tự động tại sân bay quốc tế Entebbe. Hộ chiếu truyền thống sẽ vẫn được sử dụng trong thời hạn chuyển đổi kéo dài 2 năm, dự kiến chấm dứt vào tháng 1-2021.