Trước đó, Thanh tra TP đã có kết luận về những sai phạm của Tổng Công ty Liksin trong việc chuyển nhượng đối với nhà, đất tại địa chỉ 51-53 An Dương Vương (quận 5) và khu đất lô số 7-7A đường số 4, Khu công nghiệp Tân Tạo (quận Bình Tân), gây thiệt hại ngân sách Nhà nước. Theo kết luận thanh tra, nhà đất tại khu đất số 51-53 An Dương Vương có diện tích đất hơn 2.410m², diện tích sàn sử dụng gần 5.000m² có giá trị lợi thế vị trí địa lý và thương mại. Năm 2007, UBND TP phê duyệt giá bán cho Tổng Công ty Liksin là hơn 272 tỷ đồng. Đến năm 2009, khi hợp tác với Công ty cổ phần Đầu tư An Đông kinh doanh dự án, Tổng Công ty Liksin thẩm định giá nhà đất trên hơn 380 tỷ đồng.
Đến năm 2015, Hội đồng thẩm định giá (Sở Tài chính TP) duyệt giá hơn 257 tỷ đồng. Thanh tra TP kết luận, giá này không hợp lý, chưa bảo đảm sát giá thị trường và chưa phản ánh đúng giá trị lợi thế vị trí địa lý, lợi thế thương mại khu đất, làm giảm giá trị tài sản, giảm nguồn thu của đơn vị.
Về khu đất số 7-7A đường số 4, Khu công nghiệp Tân Tạo, năm 2015, Sở Tài chính TP có văn bản gia hạn thời hiệu giá để bán đấu giá. Song, đơn vị này vẫn áp giá bán khởi điểm của năm 2013 là 35,7 tỷ đồng/10.200m² mà không thực hiện trình tự thủ tục theo quy định để thẩm định lại giá trị quyền sử dụng đất tại thời điểm bán đấu giá, gây thiệt hại cho ngân sách.
