Cơ quan mới do Thủ tướng Yoshihide Suga đứng đầu và Bộ trưởng Số hóa Takuya Hirai phụ trách điều hành. Ông Yoko Ishikura, giáo sư danh dự của Đại học Hitotsubashi, đảm nhận vị trí giám sát kỹ thuật số. Trong số khoảng 600 thành viên của cơ quan, hơn 30% xuất thân từ khu vực tư nhân, phần còn lại là các quan chức từ bộ công nghiệp, truyền thông và các trợ lý, nhân viên văn phòng các bộ.
Chính phủ của Thủ tướng Suga đặt ưu tiên cao về cải cách kỹ thuật số kể từ khi ra mắt vào tháng 9-2020. Bên cạnh việc thúc đẩy số hóa với hy vọng điều này sẽ làm cho nhiều dịch vụ thuận tiện hơn khi sử dụng, cơ quan này cũng sẽ có nhiệm vụ bảo vệ quyền riêng tư, vì môi trường số hóa tăng cường trao đổi thông tin cá nhân.