Theo cáo trạng, ngoài dự án cầu Đồng Việt ở tỉnh Bắc Giang thì ông Phạm Thái Hà còn giới thiệu cho Công ty Thuận An tham gia dự án cầu Vĩnh Tuy 2 ở Hà Nội. Dự án này được Thủ tướng Chính phủ phê duyệt chủ trương đầu tư đầu năm 2020. Tháng 7-2020, UBND TP Hà Nội ban hành quyết định phê duyệt kế hoạch lựa chọn nhà thầu và giao cho Ban quản lý dự án Hà Nội là đại diện chủ đầu tư. Sau đó, có 3 doanh nghiệp nộp hồ sơ dự thầu và liên danh Công ty Cầu 7 Thăng Long - Công ty Thuận An trúng thầu với giá gần 290 tỷ đồng.
Thời điểm đó, ông Phạm Thái Hà và Nguyễn Duy Hưng (cựu Chủ tịch HĐQT Công ty Thuận An) có quan hệ quen biết từ trước. Năm 2020, ông Phạm Thái Hà khi đó là trợ lý Bí thư Thành ủy Hà Nội (thời điểm năm 2020) đã được ông Nguyễn Duy Hưng nhờ giới thiệu để được tham gia thi công dự án cầu Vĩnh Tuy 2.
Sau đó, ông Phạm Thái Hà giới thiệu ông Nguyễn Duy Hưng gặp Phạm Hoàng Tuấn (Giám đốc Ban quản lý dự án Hà Nội) để Công ty Thuận An được tham gia thi công dự án cầu Vĩnh Tuy 2.
Cáo trạng nêu, “sau khi biết Hưng có mối quan hệ với lãnh đạo cấp cao nên vài hôm sau khi Hưng đến phòng làm việc của Tuấn đề nghị cho Công ty Thuận An tham gia thi công dự án cầu Vĩnh Tuy 2, Tuấn đồng ý và nói sẽ chỉ đạo cấp dưới tạo điều kiện trong quá trình đấu thầu để Công ty Thuận An trúng thầu thi công dự án này”.
Cũng theo cáo trạng, khoảng đầu tháng 6-2020, Phạm Hoàng Tuấn chỉ đạo 2 cấp dưới của mình là Nguyễn Chí Cường, Phạm Văn Duân tạo điều kiện cho Công ty Thuận An được tham gia thi công dự án cầu Vĩnh Tuy 2.
Cùng thời điểm trên, ông Trần Việt Khoa (Giám đốc Công ty Cầu 7 Thăng Long), biết có gói thầu cầu Vĩnh Tuy nên cũng đặt vấn đề muốn tham gia thi công. Qua giới thiệu của nhân viên ban quản lý dự án, các doanh nghiệp của Công ty Cầu 7 Thăng Long và Công ty Thuận An tiến hành liên danh để đấu thầu dù các bên đều không đủ điều kiện thi công. Kết quả, liên danh hai doanh nghiệp này trúng gói thầu trị giá hơn 290 tỷ đồng và tiến hành thi công.
Cáo trạng viết, để cảm ơn việc giúp đỡ liên danh trúng thầu và thanh quyết toán, ông Nguyễn Duy Hưng thời điểm đó đã chỉ đạo cấp dưới chi tiền cho các cá nhân tại Ban quản lý dự án Hà Nội theo tỷ lệ: giám đốc ban khoảng 1% giá trị trúng thầu; phó giám đốc phụ trách việc nghiệm thu, thanh toán hưởng 1% số tiền được thanh toán (trước thuế); chi cho phòng giám sát 2 (đơn vị trực tiếp nghiệm thu) 2% số tiền được thanh toán...
Giám đốc Công ty Cầu 7 Thăng Long cũng chỉ đạo cấp dưới chi tiền cho các cá nhân liên quan tại Ban quản lý dự án Hà Nội với tỷ lệ tương tự Công ty Thuận An.
Cụ thể, Công ty Thuận An và Công ty Cầu 7 Thăng Long đã chi cho các cá nhân tại Ban quản lý dự án Hà Nội, đơn vị tư vấn thầu, tổ tư vấn giám sát tổng số tiền hơn 12 tỷ đồng.
Trong đó, ông Phạm Hoàng Tuấn nhận 2 tỷ đồng, rồi đưa lại cho Nguyễn Anh Đức (trưởng phòng kế hoạch tổng hợp) 200 triệu đồng, còn 1,8 tỷ đồng sử dụng cá nhân. Cơ quan công tố cũng cáo buộc các ông Nguyễn Chí Cường (Phó Giám đốc Ban quản lý dự án Hà Nội) nhận 2 tỷ đồng, ông Phạm Văn Duân (Phó Giám đốc Ban quản lý dự án Hà Nội) nhận 2,32 tỷ đồng, Đỗ Đình Phan (Trưởng Phòng Giám sát 2) nhận gần 1,8 tỷ đồng..
Quá trình thi công, để có tiền bù đắp các chi phí, ông Nguyễn Duy Hưng còn gửi giá đối với 4 đơn vị thi công và nhà cung cấp vật liệu, thu gần 9,3 tỷ đồng tiền chênh lệch, đưa vào hồ sơ nghiệm thu và đã được chủ đầu tư thanh toán. Trong dự án này, cơ quan công tố cáo buộc hành vi của các ông Nguyễn Duy Hưng, Phạm Hoàng Tuấn, Nguyễn Chí Cường, Phạm Văn Duân, Đỗ Đình Phan... đã giúp cho Công ty Thuận An và liên danh trúng gói thầu số 2 dự án cầu Vĩnh Tuy 2 trái quy định gây thiệt hại gần 9,3 tỷ đồng.
