Công ty TNHH MTV Quản lý khai thác dịch vụ thủy lợi được giao tổ chức quản lý, khai thác vận hành công trình này sau khi được bàn giao chính thức. UBND các quận 12, huyện Hóc Môn và huyện Củ Chi có trách nhiệm kiểm tra các tuyến đê bao bờ hữu ven sông Sài Gòn nhằm sớm phát hiện các vị trí có nguy cơ sạt lở cao để kịp thời cảnh báo đến người dân trong khu vực cũng như phát hiện các trường hợp vi phạm trong phạm vi bảo vệ công trình thủy lợi và quy định về tải trọng xe cho phép lưu thông trên các tuyến đê bao này; tuyên truyền các quy định về quản lý, sử dụng hành lang bảo vệ đê bao bờ hữu ven sông Sài Gòn và quy định về tải trọng xe cho phép lưu thông trên các tuyến đê bao.
UBND TPHCM cũng chấp thuận điều chuyển chủ đầu tư 4 dự án thủy lợi từ Trung tâm Điều hành chương trình chống ngập nước TP sang Ban Quản lý dự án đầu tư xây dựng các công trình nông nghiệp và phát triển nông thôn, gồm: dự án nâng cấp, mở rộng và nạo vét kênh trục tiêu thoát nước rạch Láng The, kênh Địa Phận để khơi thông dòng chảy, liên kết hệ thống tiêu thoát nước chống ngập, cải thiện vệ sinh môi trường khu vực dự án và nghiên cứu đầu tư xây dựng dự án hồ điều hòa Bến Mương - Láng The, huyện Củ Chi; dự án nâng cấp, gia cố cấp bách hệ thống thủy lợi chống ngập kết hợp giao thông khu vực bờ hữu ven sông Sài Gòn (từ Rạch Tra đến sông Vàm Thuật) trên địa bàn huyện Hóc Môn, quận 12 và quận Gò Vấp; dự án nạo vét rạch Cầu Sa (giai đoạn 2); dự án nạo vét, kiên cố hóa cải thiện thoát nước chống ngập, ô nhiễm dọc tuyến kênh Trung ương, huyện Bình Chánh, Hóc Môn.
