Thành phố hiện có 100% (21/21) khu công nghiệp, khu công nghệ cao, cụm công nghiệp có hệ thống xử lý nước thải tập trung với tổng lượng nước thải 49.370m3/ngày, nhưng chỉ có 85% (18/21) khu công nghiệp, cụm công nghiệp có hệ thống quan trắc tự động và đường truyền dữ liệu. Còn Khu công nghiệp Lê Minh Xuân 3, Khu công nghiệp Cơ khí Ô tô và Cụm công nghiệp Nhị Xuân chưa lắp đặt hệ thống quan trắc nước thải tự động.
Trong năm 2018, Sở Tài nguyên và Môi trường TPHCM sẽ giám sát thường xuyên chất lượng nước thải tại các trạm quan trắc nước thải tự động ở các khu trên và yêu cầu chủ đầu tư hạ tầng triển khai lắp đặt hệ thống quan trắc nước thải tự động theo quy định.