Người phát ngôn Cảnh sát Quốc gia Indonesia, Tướng Dedi Prasetyo, cho biết, kẻ chủ mưu có tên là Abu Hilwa, biệt danh Andalus, đã bị bắt giữ tại tỉnh Trung Java, được cho là một thành viên của Jemaah Anshorut Daulah (JAD), nhóm thánh chiến tuyên bố trung thành với tổ chức khủng bố Nhà nước Hồi giáo (IS) tự xưng ở Syria. Trong quá trình thẩm vấn, Hilwa đã khai nhận cùng 3 đối tượng khác âm mưu tấn công lực lượng cảnh sát ở Yogyakarta.
Hilwa từng bị trục xuất khỏi Philippines sau khi đối tượng này tham gia huấn luyện vũ trang cùng Adi Jihadi, một tay súng phụ trách việc cung cấp tài chính cho các đối tượng thực hiện các vụ đánh bom liều chết tại thủ đô Jakarta hồi tháng 1-2016. Trong khi đó, nhóm JAD đứng sau một loạt các vụ đánh bom liều chết tại Surabaya và tỉnh Riau hồi tháng 5-2018, khiến 32 người thiệt mạng, hàng chục người bị thương.